今回の記事、
前半は、岡田正彦 新潟大学名誉教授（医学博士）のサイトから、
後半は、ＣＤＣのサイトからの引用です。

まずは前半

▼岡田正彦 新潟大学名誉教授（医学博士）のサイト
新型コロナのエビデンス
https://okada-masahiko.sakura.ne.jp　より

Q6 なぜウイルスは変異するのか？

A 数年前、ダーウインの進化論の現代語訳が『種の起源(上下巻)』という邦題で出版されました。それを読んで、進化論の奥深さに触れると同時に、この説を否定する声が高まっていることも知りました。

否定意見というのは、たとえば「キリンの首が長いのは、高い木になっている実を食べることができ生存競争に打ち勝ったから、というのであれば地球上の生き物はすべて首が長くなっているはず」といったツッコミです。しかし自然淘汰説が根本から間違いなのではなく、生物の種ごとに何か固有の力も一緒に働いてきた、ということではないでしょうか。

そう考えると、ウイルスが変異を遂げてきた理由もわかってきます。インフルエンザ・ウイルスがよく研究されていてますので、これで見ていきましょう。まず、ウイルスの変異には以下の3つの様式があります。

・遺伝情報１個単位の突然変異

・まとまった遺伝情報の大幅な組み換え

・性質が異なるウイルスに同時感染した場合の相互組み換え

この順番に変異は大きくなり、ときに困ったことが起こります。以前、大きな問題となった新型インフルエンザや鳥インフルエンザは最後のタイプで発生したと考えられています。

人間のDNAは、ファスナーのように2本で1組のひも状となっています。その片方に変異が生じると、部分的に壊れたファスナーのように凹凸が生じるため、酵素がそれを見つけ自動的に修復するようになっています。

しかし、コロナもインフルエンザも1本のRNAしか持たないため、自動修復機能が効きません。そのため、絶えずランダムに生じている変異がそのまま残り、溜まってっていくことになります。

そこで自然淘汰が働き、ワクチン接種による中和抗体、あるいはタミフルのような 特効薬から逃れることができた変異を有するウイルスだけが生き残って いく、ということではないかと推測されるのです。

以上の考察から、ウイルスの変異を促す要因はあきらかです。「感染が濃厚に発生している」か、あるいは「ワクチン接種が大集団で密に行われている」ことです。幸い、まだ日本はどちらの条件も満たしていませんので、日本固有の変異は生じていないはずです。

【参考文献】

1) Antigenic drift vs antigenic shift. Immunology & Microbilogy, Oct 25, 2018.

2) How the flu virus can change: "drift" and "shift". CDC, Oct 15, 2019.

続いて後半は、

前半の最後に挙げられていた【参考文献】2) からの引用です。

▼https://www.cdc.gov/flu/about/viruses/change.htm
How the Flu Virus Can Change: “Drift” and “Shift”
『インフルエンザウイルスがどのように変化するか：「ドリフト」と「シフト」』
　より

Influenza viruses are constantly changing.

インフルエンザウイルスは絶えず変化しています。

They can change in two different ways.

それらは2つの異なる方法で変化する可能性があります。

Antigenic Drift

抗原連続変異

One way influenza viruses change is called “antigenic drift.”

インフルエンザウイルスが変化する1つの方法は、「抗原連続変異」と呼ばれます。

These are small changes (or mutations) in the genes of influenza viruses that can lead to changes in the surface proteins of the virus: HA (hemagglutinin) and NA (neuraminidase).

これらは、インフルエンザウイルスの遺伝子の小さな変化（または突然変異）であり、ウイルスの表面タンパク質であるHA（血球凝集素）およびNA（ノイラミニダーゼ）の変化につながる可能性があります。

The HA and NA surface proteins of influenza viruses are “antigens,”

インフルエンザウイルスのHAおよびNA表面タンパク質は「抗原」です。

which means they are recognized by the immune system and are capable of triggering an immune response, including production of antibodies that can block infection.

つまり、免疫系によって認識され、感染を阻止できる抗体の産生など、免疫応答を引き起こすことができます。

The changes associated with antigenic drift happen continually over time as the virus replicates.

抗原連続変異に関連する変化は、ウイルスが複製するにつれて、時間の経過とともに継続的に発生します。

Most flu shots are designed to target an influenza virus’ HA surface proteins/antigens.

ほとんどのインフルエンザの予防接種は、インフルエンザウイルスのHA表面タンパク質/抗原を標的にするように設計されています。

The nasal spray flu vaccine (LAIV) targets both the HA and NA of an influenza virus.

点鼻薬インフルエンザワクチン（LAIV）は、インフルエンザウイルスのHAとNAの両方を標的とします。

The small changes that occur from antigenic drift usually produce viruses that are closely related to one another,

抗原連続変異から生じる小さな変化は、通常、互いに密接に関連しているウイルスを生成します。

which can be illustrated by their location close together on a phylogenetic tree.

これは、系統樹上でのそれらの近接した位置によって説明できます。

Influenza viruses that are closely related to each other usually have similar antigenic properties.

互いに密接に関連しているインフルエンザウイルスは、通常、同様の抗原特性を持っています。

This means that antibodies your immune system creates against one influenza virus will likely recognize and respond to antigenically similar influenza viruses (this is called “cross-protection”).

これは、免疫系が1つのインフルエンザウイルスに対して作成する抗体が、抗原的に類似したインフルエンザウイルスを認識して応答する可能性が高いことを意味します（これは「交差防御」と呼ばれます）。

However, the small changes associated with antigenic drift can accumulate over time and result in viruses that are antigenically different (further away on the phylogenetic tree).

ただし、抗原連続変異に関連する小さな変化は、時間の経過とともに蓄積し、抗原的に異なるウイルスをもたらす可能性があります（系統樹のさらに離れた場所）。

It is also possible for a single (or small) change in a particularly important location on the HA to result in antigenic drift.

HA上の特に重要な場所での単一の（または小さな）変化が抗原連続変異を引き起こす可能性もあります。

When antigenic drift occurs, the body’s immune system may not recognize and prevent sickness caused by the newer influenza viruses.

抗原連続変異が発生すると、体の免疫系が新しいインフルエンザウイルスによって引き起こされる病気を認識して予防できない場合があります。

As a result, a person becomes susceptible to flu infection again,

その結果、人は再びインフルエンザに感染しやすくなります。

as antigenic drift has changed the virus enough that a person’s existing antibodies won’t recognize and neutralize the newer influenza viruses.

これは、抗原連続変異によってウイルスが変化し、既存の抗体では新型インフルエンザウイルスを認識・中和できなくなったためです。

Antigenic drift is the main reason why people can get the flu more than one time,

抗原連続変異は、人々がインフルエンザに複数回感染する可能性がある主な理由です。

and it’s also a primary reason why the flu vaccine composition must be reviewed and updated each year (as needed) to keep up with evolving influenza viruses.

また、インフルエンザウイルスの進化に対応するために、インフルエンザワクチンの組成を毎年（必要に応じて）見直し、更新する必要がある主な理由でもあります。

（以上、google, DeepLによる日本語訳）

後半の引用はまだ途中ですが、長くなり過ぎました。
続きは次の記事で。